机械工程系系办公室成立于2012年。作为院系部门的基础单位、教学管理的基层科室，系办公室目前主要担负系部行政、教学、科研、实验室管理、校企合作、学科竞赛等6大项职责，直接业务对接12个部门，是连接学院与系部、系部与师生的桥梁，是维持教学秩序有效运转的关节，具有承上启下、协调左右、沟通信息和落实工作的重要作用。在2018年、2019年创先争优评比活动中，系办公室与系部其他科室共同努力，使系党总支连续两年被评为信息商务学院“先进直属党组织”，并顺利完成了各项工作任务。
